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1、兩個主要目的: (1)從土壤中分離出能夠分解尿素的細菌; (2)統(tǒng)計每克土壤樣品中究竟含有多少這樣的細菌。,,水生耐熱細菌Taq ( Thermus aquaticus ) 耐高溫的Taq DNA聚合酶 美國微生物學(xué)科布魯克(T.Brock) 1966年發(fā)現(xiàn)耐熱細菌,研究思路,,(一)篩選菌株,,尿素分子的立體結(jié)構(gòu),CO(NH2)2+H2O CO2+2NH3,,脲 酶,分解尿素的細菌:,在微生物學(xué)中,將允許特定種類的微生物生長,同時抑制或阻止其他種類微生物生長的培養(yǎng)基。,選擇培養(yǎng)基,培養(yǎng)基配方,,背景知識,測定微生物數(shù)量的方法:,1直接計數(shù)法: 最常用顯微鏡直接計數(shù)法。,測定微生物數(shù)量
2、的方法:,,背景知識,1直接計數(shù)法: 最常用顯微鏡直接計數(shù)法。 先將待測樣品制成懸液,然后取一定量的懸液放在顯微鏡下進行計數(shù)。根據(jù)在顯微鏡下觀察到的微生物數(shù)目來計算出單位體積內(nèi)的微生物總數(shù)。,測定微生物數(shù)量的方法:,,背景知識,優(yōu)點:設(shè)備簡單、能觀察微生物的形態(tài)特征。,優(yōu)點:設(shè)備簡單、能觀察微生物的形態(tài)特征。 缺點:難以計數(shù)微小量多的細菌。 一般用于純培養(yǎng)懸浮液中各種單細胞菌體的計數(shù)。,2間接計數(shù)法: 最常用稀釋平板計數(shù)法。,,,(二)統(tǒng)計菌落數(shù)目,,,(二)統(tǒng)計菌落數(shù)目,統(tǒng)計菌落數(shù)目的理論依據(jù): 當(dāng)樣品的稀釋度足夠高時,培養(yǎng)基表面生長的一個菌落,來源于樣品稀釋液中的一個活菌。因此,恰當(dāng)?shù)?/p>
3、稀釋度是成功地統(tǒng)計菌落數(shù)目的關(guān)鍵。為了保證結(jié)果準確,通常將幾個稀釋度下的菌液都涂布在平板上,培養(yǎng)后再選擇菌落數(shù)在30300的平板進行計數(shù)。,,每克樣品中的菌株數(shù) = (CV)M,C:某一稀釋度下平板上生長的平均 菌落數(shù) V:涂布平板時所用的稀釋液的體積 (ml) M:稀釋倍數(shù),統(tǒng)計的菌落往往比活菌的實際數(shù)目低。這是因為當(dāng)兩個或多個細胞連在一起時,平板上觀察到的只是一個菌落。因此結(jié)果一般用菌落數(shù)而不是活菌數(shù)來表示。,注意:,兩位同學(xué)用稀釋涂布平板法測定同一土壤樣品中的細菌數(shù)。在對應(yīng)稀釋倍數(shù)為106的培養(yǎng)基中,得到以下兩種統(tǒng)計結(jié)果。 1.第一位同學(xué)在該濃度下涂布了一個平板,統(tǒng)計的菌落數(shù)為230
4、。 2.第二位同學(xué)在該深度下涂布了三個平板,統(tǒng)計的菌落數(shù)分別為21、212和256,該同學(xué)以這三個平板菌落數(shù)的平均值163作為統(tǒng)計結(jié)果。,,實例1,,你認為哪位同學(xué)的結(jié)果更接近真實值?這兩位同學(xué)的實驗需要改進嗎?如果需要,如何改進?,?,,你認為哪位同學(xué)的結(jié)果更接近真實值?這兩位同學(xué)的實驗需要改進嗎?如果需要,如何改進?,第一位同學(xué)只涂布了一個平板,沒有設(shè)置重復(fù)組,因此結(jié)果不具有說服力。第二位同學(xué)考慮到設(shè)置重復(fù)組的問題,涂布了3個平板,但是,其中1個平板的計數(shù)結(jié)果與另2個相差太遠,說明在操作過程中可能出現(xiàn)了錯誤,因此,不能簡單地將3個平板的計數(shù)值用來求平均值。,?,因此,這兩位同學(xué)的實驗需要改
5、進,在設(shè)計實驗時,一定要涂布至少3個平板,作為重復(fù)組,才能增強實驗的說服力與準確性。在分析實驗結(jié)果時,一定要考慮所設(shè)置的重復(fù)組的結(jié)果是否一致,結(jié)果不一致,意味著操作有誤,需要重新實驗。,說明設(shè)置重復(fù)組的重要性。,,在做本課題的實驗時,A同學(xué)從對應(yīng)106倍稀釋的培養(yǎng)基中篩選出大約150個菌落。但是,其它同學(xué)在同樣的稀釋度下只選擇出大約50個菌落。 其他同學(xué)認為A同學(xué)的結(jié)果有問題。他們分析可能是A同學(xué)的培養(yǎng)基被雜菌污染了,或者培養(yǎng)基中混入了其他含氮物質(zhì),因而導(dǎo)致不能分解尿素的細菌也能在該培養(yǎng)基上生長。,實例2,但是,A同學(xué)確信自己的實驗操作準確無誤,與其他同學(xué)的結(jié)果之所以不相同,是因為自己所選用的
6、土壤樣品不同。但是,A同學(xué)在設(shè)計實驗的時候并沒有設(shè)置對照,因而此時也拿不出令同學(xué)們信服的證據(jù)。 你能通過設(shè)置對照,幫助A同學(xué)排除上述兩個可能影響實驗結(jié)果的因素嗎?,一是由于土樣不同,二是由于培養(yǎng)基污染或操作失誤。究竟是哪個原因,可以通過實驗來證明。 一種方案:可以由其他同學(xué)用與A同學(xué)一樣的土樣進行實驗,如果結(jié)果與A同學(xué)一致,則證明A無誤;如果結(jié)果不同,則證明A同學(xué)存在操作失誤或培養(yǎng)基的配制有問題。,另一種方案: 將A同學(xué)配制的培養(yǎng)基在不加土樣的情況下進行培養(yǎng),作為空白對照,以證明培養(yǎng)基是否受到污染。 通過這個事例可以看出,實驗結(jié)果要有說服力,對照的設(shè)置是必不可少的。,,實驗設(shè)計,土壤中分解尿素的細菌的分離與記數(shù),